Glavne prednosti koje omogućava projekt epSOS putem interoperabilnosti između e-zdravstvenih sustava u različitim europskim zemljama su:
• podrška mobilnosti građana u Europi,
• osiguranje bolje i sigurnije skrbi za pacijente,
• povećanje učinkovitosti i djelotvornosti zdravstvenih usluga u prekograničnom kontekstu te
• osiguranje sigurne i pouzdane zdravstvene usluge na nacionalnoj i na europskoj razini.